Họ Berberidaceae

Họ Berberidaceae gồm Berberis, Caulophyllum, Epimedium, Nandina, Podophyllum, Mahonia, Sinopodophyllum, Dysosma chi và 16 loài được sử dụng ở 11vùng lãnh thổ điều trị 14chứng và bệnh.

Họ Berberidaceae gồm8 chi và 16loài đã ghi nhận sử dụng làm thuốc tại 11 vùng và lãnh thổ. Thống kê cho thầy các loài thuộc họ này có thể điều trị các chứng và bệnh phổ biến nhất gồm thuốc bổ (7 loài), chất khử trùng (3 loài), họ sẽ mở (3 loài), chất độc (2 loài), gây nôn (2 loài) . 05 loài thực vật gồm **Podophyllum peltatum* (4 chứng và bệnh), Berberis vulgaris (3 chứng và bệnh), Sinopodophyllum hexandrum (3 chứng và bệnh), Berberis thunbergii (2 chứng và bệnh), Caulophyllum thalictroides (2 chứng và bệnh)* được xem là sử dụng điều trị nhiều chứng và bệnh nhất. Trong đó, các loài phân lập và xác định được nhiều thành phần nhất gồm Epimedium grandiflorum ( 214 hoạt chất), Epimedium sagittatum ( 160 hoạt chất), Berberis vulgaris ( 75 hoạt chất), Sinopodophyllum hexandrum ( 70 hoạt chất), Caulophyllum thalictroides ( 68 hoạt chất). Loài dược liệu quan trọng thuộc họ này là Epimedium grandiflorum

Dược dân tộc

1.Tổng quan về thực vật

Họ Berberidaceae có tổng cộng 8 chi và 16 loài.

	genus_GIBF	species_GIBF	Count
Row0	Berberis	Berberis aristata, Berberis asiatica, Berberis lycium, Berberis thunbergii, Berberis vulgaris	5
Row3	Epimedium	Epimedium grandiflorum, Epimedium sagittatum, Epimedium sempervirens, Epimedium setosum	4
Row4	Mahonia	Mahonia nervosa, Mahonia repens	2
Row1	Caulophyllum	Caulophyllum thalictroides	1
Row2	Dysosma	Dysosma versipellis	1
Row5	Nandina	Nandina domestica	1
Row6	Podophyllum	Podophyllum peltatum	1
Row7	Sinopodophyllum	Sinopodophyllum hexandrum	1

Phân bố họ trên thế giới: nan, Tanzania, United Republic of, Albania, Nepal, Korea, Republic of, Bhutan, Finland, Spain, Mexico, Sweden, unknown or invalid, South Africa, Australia, Myanmar, Russian Federation, Estonia, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, India, United States of America, China, Pakistan, Norway, New Zealand, Belgium, Italy, Denmark, Portugal, Afghanistan, Canada, Germany, Poland, Czechia, Austria, France, Switzerland, Netherlands, Hungary, Belarus, Romania, Ukraine, Croatia, Slovenia, Slovakia, Japan, Chinese Taipei, Hong Kong

2. Tổng quan về thành phần hóa học

Từ họ Berberidaceae có tổng cộng 8 chi và 16 loài.đã phân lập và xác định được 807 hoạt chất từ một số nhóm chính Statistic_Group_Compound. Phân tích sâu hơn về thành phần hóa học giữa các nhóm chúng tôi đề xuất hai hướng tiếp cận sau.

2.1 Hợp chất tìm thấy nhiều nhất trong họ Berberidaceae

Sau khi tải dữ liệu từ Lotus, các hợp chất sẽ được thống kê lại xem đâu là hoạt chất có tần số xuất hiện trong các loài nhiều nhất.

“Hoạt chất phổ biến trong họ”

”

LTS0101484

LTS0253245

LTS0004651

LTS0155822

LTS0204616

2.2 Tìm kiếm sự tương đồng

Find Maximum Common Substructure

Thuật toán FMCS (Find Maximum Common Substructure) là một phương pháp được sử dụng để tìm ra cấu trúc chung nhiều nhất (MCS) trong một tập hợp các cấu trúc hóa học. Các bước của thuật toán gồm:

Chọn một cấu trúc hóa học là cấu trúc để tạo truy vấn, còn các cấu trúc khác là mục tiêu.
Chia nhỏ cấu trúc để tạo truy vấn thành cấu trúc nhỏ hơn dạng chuỗi SMARTS.
Kiểm tra chuỗi SMARTS trong các cấu trúc mục tiêu.
Tìm kiếm chuỗi SMARTS xuất hiện nhiều nhất.

Để biết thêm chi tiết các bạn có thể xem tại TeachOpenCADD

pip install rdkit
def find_core_smiles(smiles_list):
    mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
    mcs = rdFMCS.FindMCS(mols)
    core_smiles = Chem.MolToSmiles(Chem.MolFromSmarts(mcs.smartsString))
    return core_smiles

“Khung của từng nhóm chất dựa MCS”

”

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3OC)C)ccc1O

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3O)CCCO)ccc1O

Oc1ccc(cc1)C2Cc3cc(O)cc4c3C(c5c2c(cc(c5)O)O)C(O4)c6ccc(cc6)O

C=CCc1cc(OC)c(cc1)OC(CC)c2ccccc2

**=Cc1cc(OC)c2c(c1)C(C)C(O2)c3ccc(c(c3)OC)O

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3)CCCO)ccc1O

c1cccc2c1C(c3cc(O)cc(c3)O)C(O2)c4ccc(cc4)O

**C1C2CC3N(C1*)C4C2C(C5(C3Nc6c5cccc6)C4)O

c1cc()c2c(c1)Cc3c(C2=O)c(ccc3)O

*c1cc(O)c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

*c1ccc2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)cccc3

Cc1cc(O)c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

COC1OC(C2c3cccc(c3C(c4c2cc(cc4O))=O)O)C(C(C1O)O)O

c1cc()c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

O=C1c2ccccc2C(c3c1ccc(c3))=O

c1ccc2c3c1-c4ccccc4CC3NCC2

Oc1ccc(cc1O)CC2c3c(cc(c(c3)O)OC)CCN2C

COc1ccc(cc1*)CC2NCCc3c2cccc3

COc1c(*)cc(cc1)CCNCCc2ccccc2

COc1cc2c(cc1O)C(Cc3cccc(c3)O)N(CC2)C

COc1ccc(cc1O)CC2c3c(cc(c(c3)O)OC)CCN2C

c1cc2c(cc1)C(c3ccccc3)C(C(=C2)C)C

CCC1(CCCN2C1C(CC2)(C(=C(=O)C)*)c3ccccc3)C

C(CCC1()CCCC2=C3C1CC(C3CC2)C(=O)OC)(C)*

O=C(O)c1cc(O)c(c(c1)O)O

=C()c1ccccc1

3. Tổng quan dược dân tộc học

Họ Berberidaceae đã được một số công động tại các quốc gia như Elsewhere, Turkey, India, China, ain, US, Japan, US(Amerindian), US(Appalachia), US(Flathead), Nepal sử dụng trên lâm sàng bao gồm cả chữa bệnh cũng như cảnh báo về độc tính thuốc bổ, họ sẽ mở, chất khử trùng, dạ dày, tử cung, thuốc lợi tiểu, chất độc, thuốc kích thích tình dục, thuốc chống ho, gây nôn, thuốc nhuận tràng, thuốc nhỏ mắt, chất gây say, thuốc gây mật. Bảng tổng kết chi tiết được trình bày ở dưới đây.

Các loài sử dụng phổ biến đề điều trị bệnh bao gồm Podophyllum peltatum (4 chứng và bệnh), Berberis vulgaris (3 chứng và bệnh), Sinopodophyllum hexandrum (3 chứng và bệnh), Berberis thunbergii (2 chứng và bệnh), Caulophyllum thalictroides (2 chứng và bệnh).

Tiếp cận dựa trên chứng và bệnh để điều trị cho thấy các bệnh phổ biến mà các loài cho họ Berberidaceae có thể điều trị là thuốc bổ (7 loài), chất khử trùng (3 loài), họ sẽ mở (3 loài), chất độc (2 loài), gây nôn (2 loài).

	genus_GIBF	Country- Species - Disease
Row0	Berberis	Elsewhere - (Berberis aristata - thuốc bổ), Turkey - (Berberis aristata - thuốc bổ), India - (Berberis asiatica - họ sẽ mở), Elsewhere - (Berberis lycium - họ sẽ mở), China - (Berberis thunbergii - chất khử trùng), Elsewhere - (Berberis thunbergii - dạ dày), Elsewhere - (Berberis vulgaris - thuốc bổ), Turkey - (Berberis vulgaris - chất khử trùng), ain - (Berberis vulgaris - tử cung)
Row1	Caulophyllum	Elsewhere - (Caulophyllum thalictroides - thuốc lợi tiểu), Turkey - (Caulophyllum thalictroides - thuốc lợi tiểu), US - (Caulophyllum thalictroides - chất độc)
Row2	Dysosma	China - (Dysosma versipellis - chất khử trùng)
Row3	Epimedium	Elsewhere - (Epimedium grandiflorum - thuốc bổ), China - (Epimedium sagittatum - thuốc kích thích tình dục), Elsewhere - (Epimedium sagittatum - thuốc bổ), Japan - (Epimedium sagittatum - thuốc kích thích tình dục), Elsewhere - (Epimedium sempervirens - thuốc bổ), Elsewhere - (Epimedium setosum - thuốc bổ)
Row4	Mahonia	Elsewhere - (Mahonia nervosa - thuốc bổ), US(Flathead) - (Mahonia repens - thuốc nhỏ mắt)
Row5	Nandina	China - (Nandina domestica - thuốc chống ho), Elsewhere - (Nandina domestica - thuốc chống ho)
Row6	Podophyllum	Elsewhere - (Podophyllum peltatum - họ sẽ mở), Turkey - (Podophyllum peltatum - gây nôn), US - (Podophyllum peltatum - chất độc), US(Amerindian) - (Podophyllum peltatum - chất độc), US(Appalachia) - (Podophyllum peltatum - thuốc nhuận tràng)
Row7	Sinopodophyllum	Elsewhere - (Sinopodophyllum hexandrum - gây nôn), India - (Sinopodophyllum hexandrum - chất gây say), Nepal - (Sinopodophyllum hexandrum - thuốc gây mật)

Chi tiết một số loài

Title	Subtitle	Description
Berberis aristata	Loài Berberis aristata (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis aristata thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Tanzania, United Republic of, Albania, Nepal, Korea, Republic of, Bhutan, Finland, Spain, Mexico, Sweden, unknown or invalid, South Africa, Australia, Myanmar, Russian Federation, Estonia, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, India, United States of America, China, Pakistan, Norway, New Zealand, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ’, ‘turkey: thuốc bổ’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 1 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm protoberberine alkaloids and derivatives.
Berberis asiatica	Loài Berberis asiatica (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis asiatica thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Myanmar, Spain, United States of America, Mexico, China, unknown or invalid, Italy, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, Korea, Republic of, India, Nepal, Bhutan, Denmark. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘india: họ sẽ mở, đổ mồ hôi, chất làm lạnh, dạ dày, thuốc bổ, thuốc nhuận tràng’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 1 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm protoberberine alkaloids and derivatives.
Berberis lycium	Loài Berberis lycium (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis lycium thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, United States of America, Spain, Portugal, Pakistan, unknown or invalid, Afghanistan, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, New Zealand, Canada, India, Australia, Korea, Republic of, Nepal, Denmark. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: họ sẽ mở, thuốc tống hơi, thuốc hạ sốt’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 29 hoạt chất thuộc về 5 nhóm gồm , aporphines, isoquinolines and derivatives, proaporphines, protoberberine alkaloids and derivatives.
Berberis nervosa	Loài Berberis nervosa (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis nervosa thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Canada, United States of America. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 2 hoạt chất thuộc về 2 nhóm gồm morphinans, protoberberine alkaloids and derivatives.
Berberis repens	Loài Berberis repens (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis repens thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Germany, Canada, United States of America, Switzerland. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘us(flathead): thuốc nhỏ mắt, thuốc tránh thai’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 18 hoạt chất thuộc về 6 nhóm gồm , aporphines, furanoid lignans, isoquinolines and derivatives, organooxygen compounds, protoberberine alkaloids and derivatives.
Berberis thunbergii	Loài Berberis thunbergii (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis thunbergii thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Germany, United States of America, Poland, Sweden, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, Canada, Czechia, Austria, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: chất khử trùng, chất làm lạnh, thuốc tẩy giun’, ‘elsewhere: dạ dày’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 17 hoạt chất thuộc về 5 nhóm gồm , aporphines, isoquinolines and derivatives, protoberberine alkaloids and derivatives, tetrahydroisoquinolines.
Berberis vulgaris	Loài Berberis vulgaris (Họ Berberidaceae)	Loài Berberis vulgaris thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như France, Germany, Switzerland, Czechia, Netherlands, Finland, Austria, Hungary, Spain, Poland, Sweden, Australia, Belarus, Russian Federation, Estonia, Romania, Ukraine, United States of America, Croatia, Italy, Slovenia, Norway, Canada, Slovakia. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ’, ‘turkey: chất khử trùng, thuốc gây mật, thuốc lợi tiểu, thuốc long đờm, thuốc nhuận tràng, thuốc nhuận tràng, thuốc bổ’, ‘ain: tử cung’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 75 hoạt chất thuộc về 14 nhóm gồm ?, , aporphines, aryltetralin lignans, benzazepines, cinnamic acids and derivatives, coumarins and derivatives, flavonoids, isoquinolines and derivatives, organooxygen compounds, prenol lipids, proaporphines, protoberberine alkaloids and derivatives, steroids and steroid derivatives.
Caulophyllum thalictroides	Loài Caulophyllum thalictroides (Họ Berberidaceae)	Loài Caulophyllum thalictroides thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Canada, United States of America. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc lợi tiểu, emmenagogue’, ‘turkey: thuốc lợi tiểu, emmenagogue, thuốc tẩy giun’, ‘us: chất độc’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 68 hoạt chất thuộc về 7 nhóm gồm ?, aporphines, benzene and substituted derivatives, coumarins and derivatives, lupin alkaloids, organooxygen compounds, prenol lipids.
Epimedium grandiflorum	Loài Epimedium grandiflorum (Họ Berberidaceae)	Loài Epimedium grandiflorum thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Germany, United States of America, Spain, China, Norway, New Zealand, Canada, Japan, Korea, Republic of, Austria, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 214 hoạt chất thuộc về 15 nhóm gồm ?, 2-arylbenzofuran flavonoids, aryltetralin lignans, benzene and substituted derivatives, benzofurans, diazines, fatty acyls, flavonoids, furanoid lignans, lignan glycosides, organooxygen compounds, phenanthrenes and derivatives, prenol lipids, pyrans, stilbenes.
Epimedium sagittatum	Loài Epimedium sagittatum (Họ Berberidaceae)	Loài Epimedium sagittatum thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như United States of America, China, Chinese Taipei, unknown or invalid, Japan, Korea, Republic of. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: thuốc kích thích tình dục, thuốc tống hơi’, ‘elsewhere: thuốc bổ’, ‘japan: thuốc kích thích tình dục’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 160 hoạt chất thuộc về 13 nhóm gồm , 2-arylbenzofuran flavonoids, aryltetralin lignans, cinnamic acids and derivatives, coumarins and derivatives, fatty acyls, flavonoids, flavonolignans, furanoid lignans, lignan glycosides, organooxygen compounds, prenol lipids, steroids and steroid derivatives.
Epimedium sempervirens	Loài Epimedium sempervirens (Họ Berberidaceae)	Loài Epimedium sempervirens thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, United States of America, Japan, Korea, Republic of. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ, thuốc bổ, thuốc bổ, thuốc giải độc’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 27 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm flavonoids.
Epimedium setosum	Loài Epimedium setosum (Họ Berberidaceae)	Loài Epimedium setosum thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, unknown or invalid, Norway, Japan, Korea, Republic of. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc bổ’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 3 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm flavonoids.
Nandina domestica	Loài Nandina domestica (Họ Berberidaceae)	Loài Nandina domestica thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Japan, China, Spain, Mexico, Hong Kong, Korea, Republic of, United States of America, Australia. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: thuốc chống ho, chất độc’, ‘elsewhere: thuốc chống ho, chất độc’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 45 hoạt chất thuộc về 12 nhóm gồm aporphines, cinnamic acids and derivatives, dihydroisoquinolines, flavonoids, isoquinolines and derivatives, organooxygen compounds, phenanthrenes and derivatives, phenols, protoberberine alkaloids and derivatives, protopine alkaloids, steroids and steroid derivatives, tetrahydroisoquinolines.
Podophyllum hexandrum	Loài Podophyllum hexandrum (Họ Berberidaceae)	Loài Podophyllum hexandrum thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như China, Pakistan, Sweden, unknown or invalid, Canada, India, Nepal, Bhutan, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: gây nôn, sinh nguyên phân, thuốc nhuận tràng, thuốc bổ’, ‘india: chất gây say’, ‘nepal: thuốc gây mật, thuốc gây mật’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 70 hoạt chất thuộc về 12 nhóm gồm ?, arylnaphthalene lignans, benzene and substituted derivatives, fatty acyls, flavonoids, lignan glycosides, lignan lactones, naphthofurans, organooxygen compounds, phenols, prenol lipids, steroids and steroid derivatives.
Podophyllum peltatum	Loài Podophyllum peltatum (Họ Berberidaceae)	Loài Podophyllum peltatum thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như United States of America. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: họ sẽ mở’, ‘turkey: gây nôn, thuốc tẩy giun, thuốc nhuận tràng’, ‘us: chất độc, thuốc nhuận tràng’, ‘us(amerindian): chất độc, thuốc bổ’, ‘us(appalachia): thuốc nhuận tràng’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 45 hoạt chất thuộc về 8 nhóm gồm arylnaphthalene lignans, aryltetralin lignans, carboxylic acids and derivatives, flavonoids, lignan glycosides, lignan lactones, pyrans, steroids and steroid derivatives.
Podophyllum versipelle	Loài Podophyllum versipelle (Họ Berberidaceae)	Loài Podophyllum versipelle thuộc họ Berberidaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, United States of America, China, New Zealand, Canada. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: chất khử trùng, chất độc’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 32 hoạt chất thuộc về 5 nhóm gồm arylnaphthalene lignans, flavonoids, furanoid lignans, lignan lactones, steroids and steroid derivatives.