1.Tổng quan về thực vật
Họ Vitaceae có tổng cộng 4 chi và 5 loài.
| genus_GIBF | species_GIBF | Count | |
|---|---|---|---|
| Row1 | Cissus | Cissus adnata, Cissus quadrangularis | 2 |
| Row0 | Ampelopsis | Ampelopsis japonica | 1 |
| Row2 | Parthenocissus | Parthenocissus quinquefolia | 1 |
| Row3 | Vitis | Vitis vinifera | 1 |
Phân bố họ trên thế giới: nan, United States of America, Russian Federation, Chinese Taipei, China, Portugal, Japan, Andorra, Korea, Republic of, Korea (Democratic People’s Republic of), Ukraine, Viet Nam, Myanmar, Thailand, Philippines, Brunei Darussalam, Brazil, India, Australia, Solomon Islands, Indonesia, Lao People’s Democratic Republic, Benin, Chad, Tanzania, United Republic of, Somalia, Kenya, Nepal, Singapore, Sri Lanka, Oman, Niger, Spain, Guadeloupe, Rwanda, Réunion, South Africa, Martinique, Sudan, Madagascar, Mauritius, Saudi Arabia, Nigeria, Mozambique, Burkina Faso, Togo, Central African Republic, Ethiopia, Uganda, Botswana, Malaysia, Germany, Mexico, Sweden, Bahamas, Canada, New Zealand, France, Israel, Switzerland, Czechia, Chile, Netherlands, Bulgaria, Hungary, Poland, Bosnia and Herzegovina, Palestine, State of, Montenegro, Estonia, Romania, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, Iraq, Türkiye, Georgia, Croatia, Kazakhstan, Italy, Slovenia, Norway, Greece, Morocco, Ecuador, Tajikistan, Austria, Belgium
2. Tổng quan về thành phần hóa học
Từ họ Vitaceae có tổng cộng 4 chi và 5 loài.đã phân lập và xác định được 739 hoạt chất từ một số nhóm chính Statistic_Group_Compound. Phân tích sâu hơn về thành phần hóa học giữa các nhóm chúng tôi đề xuất hai hướng tiếp cận sau.
2.1 Hợp chất tìm thấy nhiều nhất trong họ Vitaceae
Sau khi tải dữ liệu từ Lotus, các hợp chất sẽ được thống kê lại xem đâu là hoạt chất có tần số xuất hiện trong các loài nhiều nhất.2.2 Tìm kiếm sự tương đồng
Thuật toán FMCS (Find Maximum Common Substructure) là một phương pháp được sử dụng để tìm ra cấu trúc chung nhiều nhất (MCS) trong một tập hợp các cấu trúc hóa học. Các bước của thuật toán gồm:
- Chọn một cấu trúc hóa học là cấu trúc để tạo truy vấn, còn các cấu trúc khác là mục tiêu.
- Chia nhỏ cấu trúc để tạo truy vấn thành cấu trúc nhỏ hơn dạng chuỗi SMARTS.
- Kiểm tra chuỗi SMARTS trong các cấu trúc mục tiêu.
- Tìm kiếm chuỗi SMARTS xuất hiện nhiều nhất.
Để biết thêm chi tiết các bạn có thể xem tại TeachOpenCADD
pip install rdkit
def find_core_smiles(smiles_list):
mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
mcs = rdFMCS.FindMCS(mols)
core_smiles = Chem.MolToSmiles(Chem.MolFromSmarts(mcs.smartsString))
return core_smiles3. Tổng quan dược dân tộc học
Họ Vitaceae đã được một số công động tại các quốc gia như China, Elsewhere, Ketela beruk, Sudan, Mexico, Turkey, US, US(Kiowa), Iraq, ain sử dụng trên lâm sàng bao gồm cả chữa bệnh cũng như cảnh báo về độc tính alexiteric, chất làm se, thuốc lợi tiểu, thuốc giải độc, dạ dày, thuốc long đờm, mỹ phẩm, làm dịu, giờ mở cửa, chất gây say. Bảng tổng kết chi tiết được trình bày ở dưới đây.
Các loài sử dụng phổ biến đề điều trị bệnh bao gồm Vitis vinifera (6 chứng và bệnh), Parthenocissus quinquefolia (3 chứng và bệnh), Ampelopsis japonica (2 chứng và bệnh), Cissus adnata (2 chứng và bệnh), Cissus quadrangularis (1 chứng và bệnh).
Tiếp cận dựa trên chứng và bệnh để điều trị cho thấy các bệnh phổ biến mà các loài cho họ Vitaceae có thể điều trị là chất làm se (2 loài), dạ dày (2 loài), thuốc long đờm (2 loài), thuốc lợi tiểu (2 loài), chất gây say (1 loài).
| genus_GIBF | Country- Species - Disease | |
|---|---|---|
| Row0 | Ampelopsis | China - (Ampelopsis japonica - alexiteric), Elsewhere - (Ampelopsis japonica - chất làm se) |
| Row1 | Cissus | Elsewhere - (Cissus adnata - thuốc lợi tiểu), Ketela beruk - (Cissus adnata - thuốc giải độc), Sudan - (Cissus quadrangularis - dạ dày) |
| Row2 | Parthenocissus | Mexico - (Parthenocissus quinquefolia - thuốc long đờm), Turkey - (Parthenocissus quinquefolia - chất làm se), US - (Parthenocissus quinquefolia - thuốc long đờm), US(Kiowa) - (Parthenocissus quinquefolia - mỹ phẩm) |
| Row3 | Vitis | China - (Vitis vinifera - thuốc lợi tiểu), Elsewhere - (Vitis vinifera - thuốc long đờm), Iraq - (Vitis vinifera - dạ dày), Turkey - (Vitis vinifera - làm dịu), US - (Vitis vinifera - giờ mở cửa), ain - (Vitis vinifera - chất gây say) |
Chi tiết một số loài
| Title | Subtitle | Description | |
|---|---|---|---|
|
Ampelopsis japonica | Loài Ampelopsis japonica (Họ Vitaceae) | Loài Ampelopsis japonica thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, United States of America, Russian Federation, Chinese Taipei, China, Portugal, Japan, Andorra, Korea, Republic of, Korea (Democratic People’s Republic of), Ukraine, Viet Nam. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: alexiteric, cầm máu’, ‘elsewhere: chất làm se’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 15 hoạt chất thuộc về 7 nhóm gồm benzene and substituted derivatives, fatty acyls, flavonoids, lignan glycosides, saturated hydrocarbons, steroids and steroid derivatives, stilbenes. |
|
|
Cissus adnata | Loài Cissus adnata (Họ Vitaceae) | Loài Cissus adnata thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Myanmar, Thailand, Philippines, Brunei Darussalam, Chinese Taipei, China, Brazil, India, Australia, Solomon Islands, Indonesia, Lao People’s Democratic Republic, Viet Nam. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: thuốc lợi tiểu’, ‘ketela beruk: thuốc giải độc’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 3 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm indanes. |
|
Cissus quadrangularis | Loài Cissus quadrangularis (Họ Vitaceae) | Loài Cissus quadrangularis thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Benin, Chad, Tanzania, United Republic of, Somalia, Kenya, Nepal, Singapore, Sri Lanka, Oman, Niger, Spain, Guadeloupe, Chinese Taipei, Rwanda, Réunion, South Africa, Martinique, Sudan, Madagascar, Mauritius, Saudi Arabia, Nigeria, Mozambique, Burkina Faso, India, Togo, Central African Republic, Thailand, Ethiopia, Uganda, Botswana, Malaysia. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘sudan: dạ dày’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 52 hoạt chất thuộc về 8 nhóm gồm fatty acyls, flavonoids, indanes, organooxygen compounds, prenol lipids, steroids and steroid derivatives, stilbenes, unsaturated hydrocarbons. |
|
Leea guineensis | Loài Leea guineensis (Họ Vitaceae) | Loài Leea guineensis thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Dominican Republic, Indonesia, Réunion, India, Madagascar, Brazil, Cameroon, Chinese Taipei, Tanzania, United Republic of, Thailand, Benin, Puerto Rico, Philippines, Congo, Democratic Republic of the, Uganda, Mauritius, Burkina Faso, Gabon, Côte d’Ivoire, Nigeria, Palau. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘africa: thuốc nhuận tràng’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 1 hoạt chất thuộc về 1 nhóm gồm flavonoids. |
|
Parthenocissus quinquefolia | Loài Parthenocissus quinquefolia (Họ Vitaceae) | Loài Parthenocissus quinquefolia thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Germany, United States of America, Mexico, Sweden, Bahamas, South Africa, Canada, New Zealand, Australia. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘mexico: thuốc long đờm, thuốc bổ, bàng quang’, ‘turkey: chất làm se, thuốc lợi tiểu, chất kích thích, thuốc bổ, thuốc long đờm, chất khử trùng’, ‘us: thuốc long đờm, chất độc, thuốc bổ’, ‘us(kiowa): mỹ phẩm’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 15 hoạt chất thuộc về 4 nhóm gồm 2-arylbenzofuran flavonoids, dihydrofurans, organooxygen compounds, stilbenes. |
|
Vitis vinifera | Loài Vitis vinifera (Họ Vitaceae) | Loài Vitis vinifera thuộc họ Vitaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Germany, France, Israel, Switzerland, Czechia, Chile, Netherlands, Korea, Republic of, Bulgaria, Hungary, Oman, Spain, Poland, Mexico, Bosnia and Herzegovina, Sweden, South Africa, Palestine, State of, Nigeria, Montenegro, Russian Federation, Estonia, Portugal, Romania, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, Iraq, India, Türkiye, Ukraine, Georgia, United States of America, Croatia, China, Ethiopia, Kazakhstan, Italy, Slovenia, Norway, New Zealand, Greece, Morocco, Canada, Ecuador, Tajikistan, Austria, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘china: thuốc lợi tiểu, chất làm lạnh’, ‘elsewhere: thuốc long đờm, thuốc nhuận tràng, chất làm se, làm dịu, thuốc lợi tiểu, chất làm lạnh, dạ dày’, ‘iraq: dạ dày’, ‘turkey: làm dịu, thuốc lợi tiểu, thuốc nhuận tràng, chất làm lạnh, thuốc bổ, chất làm se, cầm máu, chất gây say’, ‘us: giờ mở cửa, chất gây say’, ‘ain: chất gây say’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 654 hoạt chất thuộc về 53 nhóm gồm ?, 2-arylbenzofuran flavonoids, 3,4-dihydrocoumarins, anthracenes, aryltetralin lignans, benzene and substituted derivatives, benzofurans, benzothiazoles, carboximidic acids and derivatives, carboxylic acids and derivatives, cinnamic acids and derivatives, coumarans, coumarins and derivatives, diazines, dibenzylbutane lignans, dioxolanes, epoxides, fatty acyls, flavonoids, fluorenes, furanoid lignans, furans, glycerolipids, hydroxy acids and derivatives, indanes, indoles and derivatives, isoflavonoids, keto acids and derivatives, lactams, lactones, lupin alkaloids, naphthalenes, organic oxides, organoiodides, organonitrogen compounds, organooxygen compounds, oxepanes, oxolanes, peptidomimetics, phenanthrenes and derivatives, phenols, phenylpropanoic acids, prenol lipids, pyrans, pyrrolidines, saturated hydrocarbons, steroids and steroid derivatives, stilbenes, tannins, tetrahydrofurans, thioethers, thiols, unsaturated hydrocarbons. |