1.Tổng quan về thực vật
Họ Boraginaceae có tổng cộng 1 chi và 4 loài.
| genus_GIBF | species_GIBF | Count | |
|---|---|---|---|
| Row0 | Cordia | Cordia alliodora, Cordia boissieri, Cordia myxa, Cordia sebestena | 4 |
Phân bố họ trên thế giới: Virgin Islands (U.S.), French Guiana, Costa Rica, Mexico, Haiti, Colombia, Dominican Republic, Nicaragua, Ecuador, Belize, Martinique, Tonga, Puerto Rico, Peru, United States of America, nan, Benin, Malawi, Somalia, Tanzania, United Republic of, Kenya, Côte d’Ivoire, Mayotte, Cyprus, Mali, Egypt, United Arab Emirates, Australia, Madagascar, Bahrain, Indonesia, Trinidad and Tobago, Senegal, Burkina Faso, Iraq, India, Brazil, Togo, Pakistan, Comoros, Greece, Iran (Islamic Republic of), Guinea, Belgium, Cayman Islands, Curaçao, Turks and Caicos Islands, Bahamas, Cuba, Jamaica, Singapore, Antigua and Barbuda, Ghana, Guadeloupe, Virgin Islands (British), Bonaire, Sint Eustatius and Saba, Barbados, Aruba, Sint Maarten (Dutch part), Honduras, Saint Kitts and Nevis, Thailand, Bermuda, Malaysia, Maldives
2. Tổng quan về thành phần hóa học
Từ họ Boraginaceae có tổng cộng 1 chi và 4 loài.đã phân lập và xác định được 54 hoạt chất từ một số nhóm chính Statistic_Group_Compound. Phân tích sâu hơn về thành phần hóa học giữa các nhóm chúng tôi đề xuất hai hướng tiếp cận sau.
2.1 Hợp chất tìm thấy nhiều nhất trong họ Boraginaceae
Sau khi tải dữ liệu từ Lotus, các hợp chất sẽ được thống kê lại xem đâu là hoạt chất có tần số xuất hiện trong các loài nhiều nhất.2.2 Tìm kiếm sự tương đồng
Thuật toán FMCS (Find Maximum Common Substructure) là một phương pháp được sử dụng để tìm ra cấu trúc chung nhiều nhất (MCS) trong một tập hợp các cấu trúc hóa học. Các bước của thuật toán gồm:
- Chọn một cấu trúc hóa học là cấu trúc để tạo truy vấn, còn các cấu trúc khác là mục tiêu.
- Chia nhỏ cấu trúc để tạo truy vấn thành cấu trúc nhỏ hơn dạng chuỗi SMARTS.
- Kiểm tra chuỗi SMARTS trong các cấu trúc mục tiêu.
- Tìm kiếm chuỗi SMARTS xuất hiện nhiều nhất.
Để biết thêm chi tiết các bạn có thể xem tại TeachOpenCADD
pip install rdkit
def find_core_smiles(smiles_list):
mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
mcs = rdFMCS.FindMCS(mols)
core_smiles = Chem.MolToSmiles(Chem.MolFromSmarts(mcs.smartsString))
return core_smiles3. Tổng quan dược dân tộc học
Họ Boraginaceae đã được một số công động tại các quốc gia như Elsewhere, Mexico, Iran, Haiti sử dụng trên lâm sàng bao gồm cả chữa bệnh cũng như cảnh báo về độc tính dạ dày, chất kích thích, chất gây say, làm dịu, chất làm mềm. Bảng tổng kết chi tiết được trình bày ở dưới đây.
Các loài sử dụng phổ biến đề điều trị bệnh bao gồm Cordia alliodora (2 chứng và bệnh), Cordia boissieri (1 chứng và bệnh), Cordia myxa (1 chứng và bệnh), Cordia sebestena (1 chứng và bệnh).
Tiếp cận dựa trên chứng và bệnh để điều trị cho thấy các bệnh phổ biến mà các loài cho họ Boraginaceae có thể điều trị là chất gây say (1 loài), chất kích thích (1 loài), chất làm mềm (1 loài), dạ dày (1 loài), làm dịu (1 loài).
| genus_GIBF | Country- Species - Disease | |
|---|---|---|
| Row0 | Cordia | Elsewhere - (Cordia alliodora - dạ dày), Mexico - (Cordia alliodora - chất kích thích), Mexico - (Cordia boissieri - chất gây say), Iran - (Cordia myxa - làm dịu), Haiti - (Cordia sebestena - chất làm mềm), Mexico - (Cordia sebestena - chất làm mềm) |
Chi tiết một số loài
| Title | Subtitle | Description | |
|---|---|---|---|
|
Cordia alliodora | Loài Cordia alliodora (Họ Cordiaceae) | Loài Cordia alliodora thuộc họ Cordiaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Virgin Islands (U.S.), French Guiana, Costa Rica, Mexico, Haiti, Colombia, Dominican Republic, Nicaragua, Ecuador, Belize, Martinique, Tonga, Puerto Rico, Peru. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘elsewhere: dạ dày, dạ dày, thuốc bổ, thuốc bổ’, ‘mexico: chất kích thích, chất kích thích, thuốc bổ, thuốc bổ’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 29 hoạt chất thuộc về 4 nhóm gồm anthracenes, phenol ethers, prenol lipids, tetralins. |
|
Cordia boissieri | Loài Cordia boissieri (Họ Cordiaceae) | Loài Cordia boissieri thuộc họ Cordiaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như United States of America, Mexico. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘mexico: chất gây say, chất gây say’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 5 hoạt chất thuộc về 4 nhóm gồm azoles, azolidines, flavonoids, organooxygen compounds. |
|
Cordia myxa | Loài Cordia myxa (Họ Cordiaceae) | Loài Cordia myxa thuộc họ Cordiaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như nan, Benin, Malawi, Somalia, Tanzania, United Republic of, Kenya, Côte d’Ivoire, Mayotte, Cyprus, Mali, Egypt, United Arab Emirates, Australia, Madagascar, Bahrain, Indonesia, Trinidad and Tobago, Senegal, Burkina Faso, Iraq, India, Brazil, Togo, United States of America, Pakistan, Comoros, Greece, Iran (Islamic Republic of), Guinea, Belgium. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘iran: làm dịu’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 7 hoạt chất thuộc về 3 nhóm gồm cinnamic acids and derivatives, flavonoids, organooxygen compounds. |
|
Cordia sebestena | Loài Cordia sebestena (Họ Cordiaceae) | Loài Cordia sebestena thuộc họ Cordiaceae phân bố tại một số vùng trên thế giới như Benin, Cayman Islands, Curaçao, Turks and Caicos Islands, Bahamas, Cuba, Jamaica, Singapore, Antigua and Barbuda, Ghana, Guadeloupe, French Guiana, Virgin Islands (British), Mexico, Colombia, Bonaire, Sint Eustatius and Saba, Barbados, Belize, United Arab Emirates, Martinique, Aruba, Indonesia, Virgin Islands (U.S.), Sint Maarten (Dutch part), Honduras, Senegal, Saint Kitts and Nevis, India, Thailand, United States of America, Bermuda, Dominican Republic, Malaysia, Maldives, Puerto Rico. Dược liệu đã được sử dụng ở một số vùng lãnh thổ để điều trị một số chứng và bệnh tại như ‘haiti: chất làm mềm’, ‘mexico: chất làm mềm’.Từ loài này đã phân lập và xác định được 13 hoạt chất thuộc về 2 nhóm gồm benzene and substituted derivatives, cinnamic acids and derivatives. |