Họ Rosaceae

1.Tổng quan về thực vật

Họ Rosaceae có tổng cộng 29 chi và 70 loài.

	genus_GIBF	species_GIBF	Count
Row20	Prunus	Prunus armeniaca, Prunus avium, Prunus cerasus, Prunus domestica, Prunus japonica, Prunus laurocerasus, Prunus mahaleb, Prunus mume, Prunus myrtifolia, Prunus padus, Prunus persica, Prunus salicina, Prunus serotina, Prunus tomentosa, Prunus virginiana, Prunus yedoensis, Prunus zippeliana	17
Row25	Rosa	Rosa canina, Rosa centifolia, Rosa chinensis, Rosa damascena, Rosa gallica, Rosa laevigata, Rosa multiflora	7
Row26	Rubus	Rubus coreanus, Rubus ellipticus, Rubus fruticosus, Rubus idaeus, Rubus parvifolius, Rubus rosifolius	6
Row17	Potentilla	Potentilla candicans, Potentilla erecta, Potentilla sundaica, Potentilla indica, Potentilla cryptotaeniae	5
Row10	Geum	Geum aleppicum, Geum elatum, Geum japonicum, Geum rivale	4
Row6	Crataegus	Crataegus cuneata, Crataegus monogyna, Crataegus pinnatifida	3
Row1	Alchemilla	Alchemilla alpina, Alchemilla vulgaris	2
Row5	Cotoneaster	Cotoneaster horizontalis, Cotoneaster simonsii	2
Row22	Pyracantha	Pyracantha coccinea, Pyracantha fortuneana	2
Row23	Pyrus	Pyrus communis, Pyrus pyrifolia	2
Row28	Sorbus	Sorbus americana, Sorbus aucuparia	2
Row0	Agrimonia	Agrimonia eupatoria	1
Row2	Argentina	Argentina anserina	1
Row3	Cercocarpus	Cercocarpus montanus	1
Row4	Chaenomeles	Chaenomeles japonica	1
Row7	Cydonia	Cydonia oblonga	1
Row8	Dasiphora	Dasiphora fruticosa	1
Row9	Fragaria	Fragaria vesca	1
Row11	Hagenia	Hagenia abyssinica	1
Row12	Leucosidea	Leucosidea sericea	1
Row13	Malus	Malus sylvestris	1
Row14	Margyricarpus	Margyricarpus pinnatus	1
Row15	Photinia	Photinia glabra	1
Row16	Physocarpus	Physocarpus capitatus	1
Row18	Poterium	Poterium sanguisorba	1
Row19	Prinsepia	Prinsepia utilis	1
Row21	Pseudocydonia	Pseudocydonia sinensis	1
Row24	Rhaphiolepis	Rhaphiolepis bibas	1
Row27	Sanguisorba	Sanguisorba officinalis	1

Phân bố họ trên thế giới: France, Germany, Switzerland, Czechia, Belgium, Netherlands, Hungary, Spain, Sweden, Russian Federation, Portugal, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, Ukraine, Croatia, Kazakhstan, Italy, Norway, Greece, Denmark, Austria, Luxembourg, Iceland, Greenland, Ireland, Poland, Estonia, Finland, Belarus, United States of America, Mexico, Japan, Romania, Latvia, Lithuania, New Zealand, Canada, nan, Chile, Australia, Serbia, China, unknown or invalid, Korea, Republic of, Algeria, Türkiye, Bulgaria, South Africa, Uruguay, Honduras, Montenegro, Azerbaijan, Peru, Georgia, Pakistan, Ecuador, Morocco, Slovakia, Argentina, Dominican Republic, Slovenia, Mongolia, India, Nepal, Bhutan, Chinese Taipei, Colombia, Malawi, Tanzania, United Republic of, Somalia, Ethiopia, Rwanda, Uganda, Burundi, Malaysia, Kenya, Congo, Democratic Republic of the, Lesotho, Eswatini, Brazil, Paraguay, Bolivia (Plurinational State of), Viet Nam, Guernsey, Kyrgyzstan, Iran (Islamic Republic of), Kosovo, Uzbekistan, Hong Kong, Puerto Rico, Jordan, Korea (Democratic People’s Republic of), El Salvador, Thailand, Israel, Iraq, Costa Rica, Cook Islands, Micronesia (Federated States of), Seychelles, Réunion, Guatemala, Nicaragua, Armenia, Syrian Arab Republic, Lebanon, New Caledonia, Tunisia, Saudi Arabia, North Macedonia, Myanmar, Jamaica, Sri Lanka, Isle of Man, Equatorial Guinea, Guadeloupe, Bonaire, Sint Eustatius and Saba, French Polynesia, Indonesia, Andorra, Liechtenstein, Madagascar, Bermuda, Cyprus, Albania

2. Tổng quan về thành phần hóa học

Từ họ Rosaceae có tổng cộng 29 chi và 70 loài.đã phân lập và xác định được 3514 hoạt chất từ một số nhóm chính Statistic_Group_Compound. Phân tích sâu hơn về thành phần hóa học giữa các nhóm chúng tôi đề xuất hai hướng tiếp cận sau.

2.1 Hợp chất tìm thấy nhiều nhất trong họ Rosaceae

Sau khi tải dữ liệu từ Lotus, các hợp chất sẽ được thống kê lại xem đâu là hoạt chất có tần số xuất hiện trong các loài nhiều nhất.

“Hoạt chất phổ biến trong họ”

”

LTS0226495

LTS0250838

LTS0004651

LTS0117079

LTS0265245

2.2 Tìm kiếm sự tương đồng

Find Maximum Common Substructure

Thuật toán FMCS (Find Maximum Common Substructure) là một phương pháp được sử dụng để tìm ra cấu trúc chung nhiều nhất (MCS) trong một tập hợp các cấu trúc hóa học. Các bước của thuật toán gồm:

• Chọn một cấu trúc hóa học là cấu trúc để tạo truy vấn, còn các cấu trúc khác là mục tiêu.
• Chia nhỏ cấu trúc để tạo truy vấn thành cấu trúc nhỏ hơn dạng chuỗi SMARTS.
• Kiểm tra chuỗi SMARTS trong các cấu trúc mục tiêu.
• Tìm kiếm chuỗi SMARTS xuất hiện nhiều nhất.

Để biết thêm chi tiết các bạn có thể xem tại TeachOpenCADD

pip install rdkit
def find_core_smiles(smiles_list):
    mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
    mcs = rdFMCS.FindMCS(mols)
    core_smiles = Chem.MolToSmiles(Chem.MolFromSmarts(mcs.smartsString))
    return core_smiles

“Khung của từng nhóm chất dựa MCS”

”

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3OC)C)ccc1O

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3O)CCCO)ccc1O

Oc1ccc(cc1)C2Cc3cc(O)cc4c3C(c5c2c(cc(c5)O)O)C(O4)c6ccc(cc6)O

C=CCc1cc(OC)c(cc1)OC(CC)c2ccccc2

**=Cc1cc(OC)c2c(c1)C(C)C(O2)c3ccc(c(c3)OC)O

COc1cc(C2Oc3c(C2CO)cc(cc3)CCCO)ccc1O

c1cccc2c1C(c3cc(O)cc(c3)O)C(O2)c4ccc(cc4)O

**C1C2CC3N(C1*)C4C2C(C5(C3Nc6c5cccc6)C4)O

c1cc()c2c(c1)Cc3c(C2=O)c(ccc3)O

*c1cc(O)c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

*c1ccc2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)cccc3

Cc1cc(O)c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

COC1OC(C2c3cccc(c3C(c4c2cc(cc4O))=O)O)C(C(C1O)O)O

c1cc()c2c(c1)C(=O)c3c(C2=O)c(ccc3)O

O=C1c2ccccc2C(c3c1ccc(c3))=O

c1ccc2c3c1-c4ccccc4CC3NCC2

Oc1ccc(cc1O)CC2c3c(cc(c(c3)O)OC)CCN2C

COc1ccc(cc1*)CC2NCCc3c2cccc3

COc1c(*)cc(cc1)CCNCCc2ccccc2

COc1cc2c(cc1O)C(Cc3cccc(c3)O)N(CC2)C

COc1ccc(cc1O)CC2c3c(cc(c(c3)O)OC)CCN2C

c1cc2c(cc1)C(c3ccccc3)C(C(=C2)C)C

CCC1(CCCN2C1C(CC2)(C(=C(=O)C)*)c3ccccc3)C

C(CCC1()CCCC2=C3C1CC(C3CC2)C(=O)OC)(C)*

O=C(O)c1cc(O)c(c(c1)O)O

=C()c1ccccc1

**C(=*)c1ccccc1

**c1ccccc1

*=Cc1ccccc1

=c1ccccc1

=c1ccccc1

**Cc1ccccc1

=c1ccccc1

C()()C(O)c1ccccc1

O=C(O)c1ccccc1

=C(O)c1ccc(c(c1))O

c1cccc(c1O)C(=O)O

=CCCc1ccccc1

CC(=)c1ccccc1

**c1ccc(cc1)*

**c1ccccc1

=c1ccccc1

**c1ccccc1

3. Tổng quan dược dân tộc học

Họ Rosaceae đã được một số công động tại các quốc gia như China, Dutch, Europe, French, German, Hungary, Iraq, Italian, Turkey, anish, Mexico, US, US(Tewa), Elsewhere, ain, Haiti, India, US(Appalachia), Ethiopia, Lesotho, France, Kurdistan, Chile, Canada(Kwakiutl), Canada(Salish), Eurasia, Nepal, Japan, Portuguese, Japan, Dominican Republic, US(Navajo), Venezuela, US(Colonial), US(Amerindian), US(Flathead), English* sử dụng trên lâm sàng bao gồm cả chữa bệnh cũng như cảnh báo về độc tính chất đông tụ, thuốc bổ, chất làm se, thuốc lợi tiểu, thuốc gây mật, dễ bị tổn thương, emmenagogue, thuốc tẩy giun, thuốc tống hơi, thuốc nhuận tràng, chất độc, thuốc chống ho, tiêu hóa, thuốc trợ tim, thuốc chống tiêu chảy, làm dịu, tanifuge, thuốc phá thai, diệt khuẩn, chất làm mềm, giờ mở cửa, chất làm lạnh, gây nôn, alexiteric, rubefacient, thuốc giải độc, thuốc an thần, thuốc kích thích tình dục, thuốc trừ sâu, kem đánh răng, thuốc long đờm, chống viêm, dạ dày, lo lắng, chất gây say, tim mạch, họ sẽ mở, nước hoa, chất kích thích, giải độc, cầm máu, thuốc giảm đau. Bảng tổng kết chi tiết được trình bày ở dưới đây.

Các loài sử dụng phổ biến đề điều trị bệnh bao gồm Malus sylvestris (9 chứng và bệnh), Agrimonia eupatoria (8 chứng và bệnh), Prunus persica (7 chứng và bệnh), Prunus armeniaca (5 chứng và bệnh), Prunus domestica (5 chứng và bệnh).

Tiếp cận dựa trên chứng và bệnh để điều trị cho thấy các bệnh phổ biến mà các loài cho họ Rosaceae có thể điều trị là chất làm se (24 loài), thuốc lợi tiểu (15 loài), chất độc (13 loài), thuốc chống ho (8 loài), thuốc nhuận tràng (7 loài).

	genus_GIBF	Country- Species - Disease
Row0	Agrimonia	China - (Agrimonia eupatoria - chất đông tụ), Dutch - (Agrimonia eupatoria - thuốc bổ), Europe - (Agrimonia eupatoria - chất làm se), French - (Agrimonia eupatoria - chất làm se), German - (Agrimonia eupatoria - thuốc lợi tiểu), Hungary - (Agrimonia eupatoria - thuốc gây mật), Iraq - (Agrimonia eupatoria - thuốc gây mật), Italian - (Agrimonia eupatoria - dễ bị tổn thương), Turkey - (Agrimonia eupatoria - emmenagogue), anish - (Agrimonia eupatoria - thuốc tẩy giun)
Row1	Alchemilla	Turkey - (Alchemilla alpina - thuốc tống hơi), Turkey - (Alchemilla vulgaris - chất làm se)
Row2	Argentina	Elsewhere - (Argentina anserina - thuốc bổ), Turkey - (Argentina anserina - chất làm se)
Row3	Cercocarpus	Mexico - (Cercocarpus montanus - thuốc nhuận tràng), US - (Cercocarpus montanus - chất độc), US(Tewa) - (Cercocarpus montanus - thuốc nhuận tràng)
Row4	Chaenomeles	Elsewhere - (Chaenomeles japonica - thuốc chống ho)
Row5	Cotoneaster	Europe - (Cotoneaster horizontalis - chất độc), Europe - (Cotoneaster simonsii - chất độc)
Row6	Crataegus	China - (Crataegus cuneata - tiêu hóa), ain - (Crataegus monogyna - thuốc trợ tim), China - (Crataegus pinnatifida - tiêu hóa)
Row7	Cydonia	China - (Cydonia oblonga - chất làm se), Elsewhere - (Cydonia oblonga - thuốc chống tiêu chảy), Iraq - (Cydonia oblonga - làm dịu), Mexico - (Cydonia oblonga - chất làm se), Turkey - (Cydonia oblonga - thuốc lợi tiểu)
Row8	Dasiphora	Elsewhere - (Dasiphora fruticosa - chất làm se)
Row9	Fragaria	Elsewhere - (Fragaria vesca - thuốc lợi tiểu), Haiti - (Fragaria vesca - thuốc lợi tiểu), Turkey - (Fragaria vesca - chất làm se), ain - (Fragaria vesca - thuốc lợi tiểu)
Row10	Geum	Elsewhere - (Geum aleppicum - thuốc lợi tiểu), India - (Geum elatum - chất làm se), Elsewhere - (Geum japonicum - thuốc lợi tiểu), Elsewhere - (Geum rivale - chất làm se), Turkey - (Geum rivale - chất làm se), US - (Geum rivale - thuốc tẩy giun), US(Appalachia) - (Geum rivale - thuốc bổ)
Row11	Hagenia	Elsewhere - (Hagenia abyssinica - tanifuge), Ethiopia - (Hagenia abyssinica - chất độc), Turkey - (Hagenia abyssinica - thuốc phá thai)
Row12	Leucosidea	Lesotho - (Leucosidea sericea - thuốc tẩy giun)
Row13	Malus	China - (Malus sylvestris - thuốc tống hơi), Dutch - (Malus sylvestris - thuốc lợi tiểu), Elsewhere - (Malus sylvestris - diệt khuẩn), France - (Malus sylvestris - chất làm mềm), Haiti - (Malus sylvestris - thuốc nhuận tràng), India - (Malus sylvestris - tiêu hóa), Iraq - (Malus sylvestris - giờ mở cửa), Kurdistan - (Malus sylvestris - chất làm lạnh), Turkey - (Malus sylvestris - giờ mở cửa), US - (Malus sylvestris - chất độc), ain - (Malus sylvestris - thuốc nhuận tràng)
Row14	Margyricarpus	Chile - (Margyricarpus pinnatus - thuốc lợi tiểu)
Row15	Photinia	China - (Photinia glabra - giờ mở cửa)
Row16	Physocarpus	Canada(Kwakiutl) - (Physocarpus capitatus - gây nôn), Canada(Salish) - (Physocarpus capitatus - thuốc nhuận tràng)
Row17	Potentilla	Mexico - (Potentilla candicans - chất làm se), China - (Potentilla cryptotaeniae - chất độc), Elsewhere - (Potentilla erecta - thuốc chống tiêu chảy), Eurasia - (Potentilla erecta - chất làm se), Turkey - (Potentilla erecta - chất làm se), China - (Potentilla indica - chất độc), China - (Potentilla sundaica - alexiteric)
Row18	Poterium	Turkey - (Poterium sanguisorba - giờ mở cửa)
Row19	Prinsepia	Nepal - (Prinsepia utilis - rubefacient)
Row20	Prunus	China - (Prunus armeniaca - thuốc giải độc), Elsewhere - (Prunus armeniaca - thuốc an thần), Iraq - (Prunus armeniaca - thuốc kích thích tình dục), Japan* - (Prunus armeniaca - thuốc chống ho), Kurdistan - (Prunus armeniaca - thuốc an thần), Turkey - (Prunus armeniaca - thuốc kích thích tình dục), US - (Prunus armeniaca - chất độc), Elsewhere - (Prunus avium - chất làm se), Italian - (Prunus avium - thuốc bổ), US - (Prunus avium - chất làm se), Elsewhere - (Prunus cerasus - thuốc lợi tiểu), Haiti - (Prunus cerasus - thuốc lợi tiểu), Turkey - (Prunus cerasus - thuốc an thần), US - (Prunus cerasus - thuốc an thần), China - (Prunus domestica - chất làm lạnh), Elsewhere - (Prunus domestica - làm dịu), French - (Prunus domestica - thuốc gây mật), Haiti - (Prunus domestica - thuốc nhuận tràng), Italian - (Prunus domestica - chất làm lạnh), Portuguese - (Prunus domestica - làm dịu), US - (Prunus domestica - giờ mở cửa), China - (Prunus japonica - làm dịu), Elsewhere - (Prunus japonica - thuốc lợi tiểu), Elsewhere - (Prunus laurocerasus - thuốc chống ho), Turkey - (Prunus laurocerasus - thuốc an thần), US - (Prunus laurocerasus - chất độc), Elsewhere - (Prunus mahaleb - thuốc trừ sâu), Iraq - (Prunus mahaleb - chất độc), Turkey - (Prunus mahaleb - thuốc lợi tiểu), China - (Prunus mume - giờ mở cửa), Japan - (Prunus mume - thuốc tẩy giun), Dominican Republic - (Prunus myrtifolia - kem đánh răng), Turkey - (Prunus padus - chất làm se), China - (Prunus persica - thuốc chống ho), Elsewhere - (Prunus persica - thuốc long đờm), Iraq - (Prunus persica - thuốc an thần), Japan - (Prunus persica - chống viêm), Japan* - (Prunus persica - chống viêm), Turkey - (Prunus persica - làm dịu), US - (Prunus persica - thuốc an thần), US(Navajo) - (Prunus persica - thuốc nhuận tràng), Venezuela - (Prunus persica - thuốc nhuận tràng), ain - (Prunus persica - chất độc), Elsewhere - (Prunus salicina - dạ dày), Mexico - (Prunus serotina - lo lắng), Turkey - (Prunus serotina - chất làm se), US - (Prunus serotina - thuốc long đờm), US(Appalachia) - (Prunus serotina - thuốc bổ), US(Colonial) - (Prunus serotina - thuốc tẩy giun), China - (Prunus tomentosa - làm dịu), Elsewhere - (Prunus tomentosa - thuốc lợi tiểu), US - (Prunus virginiana - chất gây say), US(Amerindian) - (Prunus virginiana - thuốc an thần), US(Colonial) - (Prunus virginiana - thuốc tẩy giun), US(Flathead) - (Prunus virginiana - thuốc nhuận tràng), Elsewhere - (Prunus yedoensis - thuốc chống ho), Japan - (Prunus yedoensis - thuốc chống ho), Elsewhere - (Prunus zippeliana - thuốc chống ho)
Row21	Pseudocydonia	China - (Pseudocydonia sinensis - thuốc giảm đau), Elsewhere - (Pseudocydonia sinensis - thuốc chống ho)
Row22	Pyracantha	Europe - (Pyracantha coccinea - chất độc), Turkey - (Pyracantha coccinea - tim mạch), China - (Pyracantha fortuneana - alexiteric)
Row23	Pyrus	Elsewhere - (Pyrus communis - diệt khuẩn), India - (Pyrus communis - thuốc lợi tiểu), Turkey - (Pyrus communis - thuốc lợi tiểu), US - (Pyrus communis - chất độc), Elsewhere - (Pyrus pyrifolia - thuốc lợi tiểu)
Row24	Rhaphiolepis	China - (Rhaphiolepis bibas - thuốc chống ho), Elsewhere - (Rhaphiolepis bibas - chất làm lạnh)
Row25	Rosa	Europe - (Rosa canina - chất làm se), Haiti - (Rosa canina - chất làm se), Turkey - (Rosa canina - chất làm se), English - (Rosa centifolia - họ sẽ mở), German - (Rosa centifolia - nước hoa), India - (Rosa centifolia - chất làm se), Iraq - (Rosa centifolia - họ sẽ mở), Italian - (Rosa centifolia - lo lắng), Kurdistan - (Rosa centifolia - lo lắng), Mexico - (Rosa centifolia - dễ bị tổn thương), China - (Rosa chinensis - chất kích thích), Elsewhere - (Rosa damascena - họ sẽ mở), Eurasia - (Rosa damascena - nước hoa), Iraq - (Rosa damascena - họ sẽ mở), Elsewhere - (Rosa gallica - chất làm se), Europe - (Rosa gallica - chất làm se), Turkey - (Rosa gallica - chất làm se), China - (Rosa laevigata - chất làm se), Elsewhere - (Rosa laevigata - thuốc chống tiêu chảy), China - (Rosa multiflora - chất làm se), Elsewhere - (Rosa multiflora - diệt khuẩn), Japan - (Rosa multiflora - thuốc nhuận tràng), Japan* - (Rosa multiflora - thuốc lợi tiểu)
Row26	Rubus	China - (Rubus coreanus - chất làm se), Nepal - (Rubus ellipticus - chất làm se), Europe - (Rubus fruticosus - chất làm se), India - (Rubus fruticosus - chất gây say), Turkey - (Rubus fruticosus - thuốc lợi tiểu), Elsewhere - (Rubus idaeus - chất làm se), Haiti - (Rubus idaeus - chất kích thích), Turkey - (Rubus idaeus - chất làm se), Elsewhere - (Rubus parvifolius - thuốc chống tiêu chảy), China - (Rubus rosifolius - giải độc)
Row27	Sanguisorba	China - (Sanguisorba officinalis - cầm máu), Elsewhere - (Sanguisorba officinalis - chất làm se), Turkey - (Sanguisorba officinalis - giờ mở cửa)
Row28	Sorbus	US - (Sorbus americana - chất làm se), Elsewhere - (Sorbus aucuparia - họ sẽ mở), Eurasia - (Sorbus aucuparia - chất gây say), Turkey - (Sorbus aucuparia - họ sẽ mở)

Chi tiết một số loài